BTN100903 AFLP試劑盒

產(chǎn)品簡介
北京百奧萊博供應(yīng)的AFLP試劑盒僅用于生物化學(xué)研究方面,AFLP試劑盒是我司眾多優(yōu)質(zhì)基因結(jié)構(gòu)和功能之一,質(zhì)量堪比同類進口產(chǎn)品,價格非常優(yōu)惠,目前正熱烈促銷中,恭候您的咨詢訂購。...
產(chǎn)品詳細介紹
特別提示:包括AFLP試劑盒(EcoRI-MseI)在內(nèi),本公司的所有產(chǎn)品僅可用于科研實驗,嚴(yán)禁用于臨床醫(yī)療及其他非科研用途!
產(chǎn)品名稱:AFLP試劑盒(EcoRI-MseI)
英文名稱:AFLP Kit(EcoRI-MseI)
產(chǎn)品貨號:BTN100903
產(chǎn)品規(guī)格:1600次
本產(chǎn)品在傳統(tǒng)AFLP-PCR的基礎(chǔ)上經(jīng)過精心優(yōu)化而開發(fā)。AFLP(amplified fragment length polymorphism)原理是一種結(jié)合RFLP和PCR技術(shù)特點的、迄今為止zuì有效分子標(biāo)記分型技術(shù),其原理如下:

產(chǎn)品特點:
1.一站式,足夠50次酶切-連接反應(yīng)、50次預(yù)擴反應(yīng)和1600次AFLP PCR(PCR按30μL體系計算),但不包括DNA 純化和帶型分析試劑(如PAGE電泳試劑和銀染試劑)。
2.本系列產(chǎn)品提供EcoRI-MseI 組合,適用于GC含量在50%以上的基因組。對GC含量在50%以下的基因組,需從本公司采購AFLP(EcoRI-TaqI)組合。
3.各種參數(shù)都經(jīng)過優(yōu)化,一次PCR所得AFLP片段數(shù)一般在10-100之間,可重復(fù)性好,誤差小于0.6%。
4.本產(chǎn)品適用于基因組在500 Mb-6000Mb的材料(如動物和植物),對于基因組在50-500Mb的材料(如細菌和真菌)或50Mb以下的材料(如質(zhì)粒,cosmid,BAC,YAC和PAC等),需要分別另購專門的+1型預(yù)擴引物混合液和+3型EcoRI引物(8 種)AFLP引物對。
試劑盒組成:
| 成分 | 規(guī)格 |
| 酶切-連接Buffer,10× | 100μl |
| EcoRI-MseI酶混合液 | 100μl |
| EcoRI-MseI 接頭混合物 | 1ml |
| T4 DNA連接酶(1U/μL) | 50μl |
| +0型預(yù)擴引物混合液 | 750μl |
| PCR Mix 3.0 | 9ml×3 |
| 對照DNA(50ng/μL) | 20μl |
| +2型EcoRI引物(8條) | 1ml每種 |
| +3型MseI引物(8條) | 1ml每種 |
| TE溶液,pH8.0 | 10ml |
| 超純水 | 10ml |
| 說明書 | 1份 |
+2型EcoRI引物和+3型MseI引物zuì后堿基的序列
| 引物名稱 | 8條引物3′zuì后堿基 |
| +2型EcoRI引物 | -AA,-AT,-AG,-AC,-TA,-TT,-TG,-TC |
| +3型MseI引物 | -CAA,-CAC,-CAG,-CAT,-CTA,-CTC,-CTG,-CTT |
儲存條件:低溫運輸、-20℃保存,有效期一年。
自備試劑:Southern級DNA純化試劑,尿素-PAGE電泳套裝,銀染試劑盒。
使用方法:
一、DNA提取(本試劑盒不提供相關(guān)試劑)
用戶需要自備50-500ng Southern級別的基因組DNA,用前zuì好預(yù)實驗以確保DNA能夠被EcoRI和MseI內(nèi)切酶徹底切開。
二、限制性酶切和接頭連接反應(yīng)(本試劑盒足夠50次本反應(yīng))
1.在0.2mL離心管中加入設(shè)置20μL的限制性內(nèi)切酶酶切體系:
| 成分 | 用量 |
| 酶切-連接Buffer,10× | 2μl |
| 樣品DNA |
50ng(對小基因組材料) 500ng(對大基因組材料) 如果用對照,則用5μL |
| EcoR I-Mse I酶混合液 | 2μl |
| 超純水 | 加水到20μl |
2.輕柔混勻并短暫離心后,37℃保溫2小時酶切(若PCR 儀器不帶熱蓋,則必須加50μL自備石蠟油,否則水分會蒸發(fā)影響反應(yīng)。下同),70℃保溫15分鐘滅活內(nèi)切酶。
3.在上述酶反應(yīng)體系中加入20μl EcoRI-MseI 接頭混合物和1μl T4 DNA連接酶,輕柔混勻并短暫離心后,20℃保溫2小時讓接頭跟DNA片段相連。
4.在一個離心管中加入10μl上步得到的連接反應(yīng)液和90μL TE緩沖液,pH8,充分混勻,得到酶切-連接反應(yīng)10倍稀釋液,未用完的酶切-連接反應(yīng)原液(30μL)可放-20℃保存。
三、預(yù)擴增(本試劑盒足夠50次本反應(yīng))
5.在0.2mL離心管中設(shè)置30μl的PCR 體系:
| 成分 | 體積 |
| 酶切-連接反應(yīng)液10倍稀釋液 | 5μl |
| +0型預(yù)擴引物混合液 | 10μl |
| PCR Mix 3.0 | 15μl |
6.離心數(shù)秒,按下列參數(shù)進行PCR預(yù)擴增:
| 溫度 | 時間 | |
| PCR(20次) | 94℃ | 30s |
| 56℃ | 60s | |
| 72℃ | 60s |
7.可以取10μl PCR產(chǎn)物在1.5%瓊脂糖膠上電泳檢測,產(chǎn)物為100-1500bp 模糊條帶。
8.將剩下的預(yù)擴反應(yīng)液用TE 稀釋50倍,直接用于下步反應(yīng)或放-20℃保存待用。
四、選擇性PCR擴增(本試劑盒足夠至少1600次本反應(yīng))
9.在0.2mL PCR 管中,加入下列成分(如果用戶已經(jīng)知道哪個一種或幾種引物組合適合自己的材料,則直接使用;如果不知道,則需要預(yù)先測試所有64 種組合,設(shè)置64個PCR反應(yīng)),下面只是一種組合:
| 成分 | 體積 |
| 預(yù)擴反應(yīng)液50倍稀釋液 | 5μl |
| +2型EcoR I引物之一(八種之一) | 5μl |
| +3型Mse I引物之一(八種之一) | 5μl |
| PCR Mix 3.0 | 15μl |
10.輕柔混勻后離心數(shù)秒,按下列參數(shù)進行PCR:
| 溫度 | 時間 | |
| PCR(13次) | 94℃ | 30s |
| 65℃ | 30s(每次循環(huán)遞減0.7℃) | |
| 72℃ | 60s | |
| PCR(13次) | 94℃ | 30s |
| 55℃ | 30s | |
| 72℃ | 60s | |
| 延伸 | 72℃ | 5min |
五、尿素-PAGE電泳和銀染(需另購試劑并按相關(guān)說明書進行)
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名稱:Aspergillosis mRNA原位雜交試劑盒
貨號:ZN0098
規(guī)格:100T
基本信息:
保存條件:4℃保存一年
工作量:100張切片。
有效期:一年。
適用種屬:human
標(biāo)記方式:3’—尾段標(biāo)記
試劑盒中內(nèi)容:
1.胃蛋白酶(×10; Pepsin)2ml;
2.預(yù)雜交液 2ml;
3.Aspergillosis mRNA原位雜交試劑盒寡核苷酸探針雜交液 2ml;
4.封閉液 5ml;
5.生物素化鼠抗地高xīn 5ml;
6.SABC-POD 5ml;
7.生物素化過氧化物酶 5ml。
用戶自備試劑:
原位雜交專用蓋玻片;POLY-L-LYSINE;DEPC;20%甘油
緩沖液(3%檸檬酸,2×SSC,0.5×SSC,0.2×SSC,原位雜交用 PBS)
一.培養(yǎng)細胞和冰凍切片
準(zhǔn)備工作:
固定液:4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6);1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6)
3%檸檬酸——100ml蒸餾水中加檸檬酸(C6H8O7?H2O)3g,PH2.0左右。
2×SSC——1000ml蒸餾水中加氯化鈉17.6g,檸檬酸三鈉(C6H5O7Na3?2H2O,分子量294)8.8g。
0.5×SSC——300ml蒸餾水加100ml 2×SSC即可。
0.2×SSC——270ml蒸餾水加30ml 2×SSC即可。
20%甘油——20ml甘油加80ml蒸餾水即可。
原位雜交用PBS(1000ml蒸餾水加氯化鈉30g,Na2HPO4?12H2O 6g,NaH2PO4?2H2O 0.4g),PH7.2-7.6。
操作程序:
注意:zuì重要的是及時固定,并在固定液中加入0.1%的DEPC處理,以抑制RNA酶對mRNA的分解作用。此外,過度固定對原位雜交有明顯的不利影響。
1.玻片的處理:一般采用多聚賴氨酸或APES。切片厚度10-20μm。
2.細胞在多聚賴氨酸處理的蓋玻片上進行培養(yǎng),條件為37℃和5%的CO2,所用培養(yǎng)基為Dulbecco基礎(chǔ)培養(yǎng)基。細胞長好后0.1M PBS(PH7.4)洗2分鐘×3次。
3.培養(yǎng)細胞和冰凍切片均可用下述方法固定:固定液為4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室溫固定 20--30分鐘。蒸餾水充分洗滌,干燥后-20℃冰凍可保存2周以上。
4.30%H2O2 1份+純甲醇50份混合,室溫處理30分鐘。蒸餾水洗滌3次。
5.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%檸檬酸新鮮稀釋的胃蛋白酶(1ml 3% 檸檬酸加2滴濃縮型胃蛋白酶,混勻),37℃或室溫消化5—120秒鐘。有時也可以不消化。原位雜交用 PBS洗3次×5分鐘。蒸餾水洗1次。
6.后固定:胃蛋白酶消化后才需要。固定液為1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室溫固定 10分鐘。蒸餾水洗滌3次。
7.預(yù)雜交:濕盒的準(zhǔn)備——干的雜交盒底部加20%甘油20ml以保持濕度。按每張切片20μι加預(yù)雜交液。恒溫箱38-42℃2—4小時。吸取多余液體,不洗。
8.雜交——按每張切片20μι雜交液,加在切片上。將原位雜交專用蓋玻片的保護膜揭開后,蓋在切片上。恒溫箱38-42℃雜交過夜(根據(jù)雜交情況可以調(diào)節(jié))。
9.雜交后洗滌:揭掉蓋玻片,37℃左右水溫的2×SSC洗滌5分鐘×2次;37℃0.5×SSC洗滌15分鐘×1次; 37℃0.2×SSC洗滌15分鐘×1次(如果有非特異性染色,重復(fù)0.2×SSC洗滌15分鐘×1-2次)。
10.滴加封閉液:37℃30分鐘。甩去多余液體,不洗
11.滴加生物素化鼠抗地高xīn:37℃ 60分鐘或室溫120分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×4次。勿用其它緩沖液和蒸餾水洗滌。
12.滴加SABC:37℃20分鐘或室溫30分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×3次。勿用其它緩沖液和蒸餾水洗滌。
13.滴加生物素化過氧化物酶:37℃20分鐘或室溫30分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×4次。
14.DAB顯色:使用DAB顯色試劑盒—1ml蒸餾水加顯色劑A,B,C各一滴,混勻,加至標(biāo)本上。一般顯色20-30分鐘。若無背景出現(xiàn)則可繼續(xù)顯色。也可自配DAB顯色劑后顯色。充分水洗。
15.必要時蘇木素復(fù)染,充分水洗。
16.酒精脫水,二甲苯透明,封片。
二.石蠟切片
如果有條件的話,應(yīng)盡可能地采用新鮮標(biāo)本。標(biāo)本離體后,及時予以固定。固定液為4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.0-7.6),含有1/1000 DEPC。標(biāo)本較大時用刀片切成厚度不超過4mm的小塊,固定1小時即可,較大的標(biāo)本固定不要超過2小時。某些組織對過度固定尤其敏感,如動物大腦,固定時間30-40分鐘,一般不要超過1小時。
1.常規(guī)脫水、浸蠟、包埋。切片厚度6-8μm。
2.玻片的處理:一般采用多聚賴氨酸或APES。
3.石蠟切片經(jīng)常規(guī)脫蠟至水。30%H2O2 1份+蒸餾水10份混合,室溫5-10分鐘以滅活內(nèi)源性酶。蒸餾水洗3次。
4.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%檸檬酸新鮮稀釋的胃蛋白酶(1ml 3% 檸檬酸加2滴濃縮型胃蛋白酶,混勻),37℃或室溫消化3--30分鐘(視標(biāo)本新舊、厚薄自行調(diào)整)。用戶可以比較不同的消化時間,例如5分鐘,10分鐘,20分鐘,30分鐘。以找到zuì佳的消化時間。原位雜交用PBS洗3次×5分鐘。蒸餾水洗1次。其余步驟和冰凍切片6-16步相同。
結(jié)果觀察:
Aspergillosis的細胞胞漿著色呈棕黃色。
注意事項:
由于特定的mRNA序列僅占總mRNA的少數(shù),加上基因僅由四個堿基排列組合而成,因此原位雜交容易出現(xiàn)非特異性染色。通過不加探針和用陰性標(biāo)本做對照,基本可以確定染色是否為特異性的。有明顯的非特異性染色現(xiàn)象時,用預(yù)雜交液對含探針的雜交液進行稀釋,一般稀釋2—10倍;并應(yīng)加強探針雜交后的洗滌。如果有少量的細胞核著色屬于正常情況;如果出現(xiàn)大量的細胞核著色,往往和標(biāo)本固定時間過長有關(guān),應(yīng)重新處理標(biāo)本。
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